１９４７年東京生まれ。４才よりピアノを始め、上智大学数学科に学んだが、音楽の志しを捨てがたく、 同大学から東京芸術大学指揮科に再入学、金子登、渡邊暁雄、山田一雄各氏に指揮法を学んだ。

　１９７０年より２年間日本フィルハーモニー交響楽団指揮研究員として小澤征爾氏の助手を務め、 あわせて秋山和慶氏にも教えを受ける。

　１９７２年東京ユース・シンフォニー・オーケストラのスイス演奏旅行に指揮者として同行、 ローザンヌ、チューリッヒ、モンタナ等で公演後ヨーロッパに留まり、以降ウィーン、ローザンヌ、ロンドン、パリと移り住み、 その間ハンス・スワロフスキー、ズデニェク・コシュラー、フランコ・フェラーラ、セルジュ・チェリビダッケ、ピエール・デルヴォー に師事した。

　１９７４年ジョン・プレイヤー国際指揮者コンクール入賞（英）、１９７５年ブザンソン国際指揮者コンクール入賞（仏）、 １９７６年ジノ・マリヌッチ・コンクール入賞（伊）し、１９７５年ボーンマス交響楽団定期演奏会を皮切りに 本格的に指揮活動を開始、ロイヤル・フィル、ＢＢＣ響、バーミンガム市響、コロンヌ管、コンセール・ラムルー管、 リヨン管、スロヴァキア・フィル、ノルウェー放送管、トゥールーズ室内管、スイス・ロマンド管、フランス国立放送フィルなどに 次々と客演し着実にキャリアを積み重ねた。 １９７９年よりパリに拠点を移し、同年には東京交響楽団定期演奏会を指揮し日本にもデビューを果たした。 １９８１年パリ・オペラ座とＩＲＣＡＭ共同制作による室内オペラ、及びダニエル・ルスュール作曲「オンディーヌ」の 世界初演でオペラにも活動の場を広げ、ベルギー王立ヴァロニー・オペラ劇場（リエージュ）、アヴィニヨン市立歌劇場、 ボルドー歌劇場、二期会、関西二期会にも客演を行った。

　１９７９年から１９８８年まで東京交響楽団指揮者、１９８６年から１９８８年までノルウェー国立放送管弦楽団（オスロ）首席客演指揮者、 １９８６年からホフ交響楽団（西独）の首席客演指揮者、１９８９年から１９９６年までホフ交響楽団の音楽監督・首席指揮者、 １９９４年よりフランス国立トゥールーズ室内管弦楽団首席客演指揮者、２０００年よりバンコク交響楽団名誉指揮者を務めている。 長年にわたる日仏音楽交流への貢献に対し、フランス政府より２０００年芸術文化勲章シュヴァリエを叙勲。

　２００２年４月には東京シティ・フィルハーモニック管弦楽団とともに「矢崎彦太郎　ｐｒｅｓｅｎｔｅ　フランス音楽の彩と翳」シリーズを開始、 長年の経験に基づく高い芸術性が内外で高く評価され、話題を呼んでいる。 ２００２年エクソンモービル音楽賞奨励賞を受賞。 ２００８年２月、フランス芸術文化勲章オフィシエを受章。 現在、東京シティ・フィルハーモニック管弦楽団首席客演指揮者。パリ在住。